Variación genética y filogeográfica del roedor octodontido Tympanoctomis barrerae (Rodentia, Octodontidae)
La rata vizcacha colorada, Tympanoctomys barrerae, es un octodóntido endémico de las regiones áridas del centro-oeste y sur de Argentina. Es una especie solitaria que habita en cuevas complejas, construidas en suelos blandos. Las poblaciones de T. barrerae se distribuyen en densidades bajas y a modo...
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Detalles Bibliográficos
- Autor principal:
- Formato:
- Tesis Libro
- Lenguaje:
- español
- Publicado:
-
Tucumán
Universidad Nacional, Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo
2010
- Colección:
- Tesis: Doctora en Ciencias Biológicas
Director: Dr. Sergio Roig Juñent
Director Asociado: Dr. Francisco Fernández
Bibliografía: h. 94-109
Apéndices: h. 111-112
Nº orden interno:TDCs.Biol. 045 - Materias:
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| Sumario: | La rata vizcacha colorada, Tympanoctomys barrerae, es un octodóntido endémico de las regiones áridas del centro-oeste y sur de Argentina. Es una especie solitaria que habita en cuevas complejas, construidas en suelos blandos. Las poblaciones de T. barrerae se distribuyen en densidades bajas y a modo de parches asociados a cuencas salinas y dunas en los biomas del Monte y Patagonia. El objetivo de esta Tesis fue investigar la estructura genética y filogeográfica de este roedor octodóntido especialista del desierto. Para ello se evaluó la variación genética, secuenciando un fragmento de 800 pb de la región control del ADN mitocondrial (ADNmt) a partir de 60 muestras de individuos de ocho localidades a lo largo de todo el rango de distribución de la especie. Las relaciones entre los haplotipos fueron interferidas a partir de análisis filogenéticos (máxima parsimonia, bayesianos y redes). Se estudio la estructura genética e historia demográfica a través de diferentes estadísticos, distribuciones pareadas, pruebas de neutralidad (Tajima y Fu) y AMOVAs. Se encontraron 26 haplotipos, la mayoría de ellos restringidos a poblaciones únicas. La presencia de haplotipos no compartidos fue consistente con las bajas tasas de migración. A lo largo de su rango geográfico (entre 29º S y 39º S), las poblaciones norte, centro y sur mostraron diferencias tanto en nivel como en la distribución de la variación genética (las poblaciones sur y norte presentaron los valores más altos de diversidad genética en relación a las poblaciones del centro). Las poblaciones de T.barrerae mostraron una moderada a alta diferenciación genética, siendo los haplotipos de las poblaciones centrales los que determinaron en mayor medida dicho grado de diferenciación (debido a su composición y frecuencia). Los análisis de AMOVA realizados para tres grupos de poblaciones (norte-centro-sur) fueron significativos, indicando un nivel moderado de estructura geográfica de las poblaciones. La baja diversidad genética (haplotípica y nucleotídica) presentada en las poblaciones centrales, podría sugerir un posible cuello de botella asociado a las glaciaciones del Pleistoceno o una intensa actividad volcánica en la parte central de su distribución geográfica. La estructura filogeográfica fue moderada y los análisis recobraron dos clados principales. A (con distribución centro y sur) y B (con distribución norte y sur). La mayoría de las poblaciones fueron polifiléticas, sugiriendo que no habrían permanecido aisladas durante un tiempo suficiente largo como para alcanzar la monofília recíproca. Los análisis demográficos realizados en cada uno de clados (A y B) resultaron en valores negatiivos para las pruebas de neutralidad (Tajima y Fu) y en una distribución unimodal de las diferencias pareadas entre sitios nucleotídicos, sugiriendo una reciente historia de expansión poblacional. ABSTRACT: The red viscacha rat, Thympanoctomys barrerae is an octodontid rodente endemic to the arid central-western and southem regions of Argentina. It is solitary specie that lives in complex burrows, built in soft soil. T. barrerae occurs at low population densities in patches associated with salt basins and sand dunes in the lowland habitats of the biogeographical provinces of Monte and Patagonia. The purpose of this study was to investgate the genetic structure and phylogeography of this desert specialist octodontid rodent. To asses genetic variation, a fragment of 800 bp of the control region mitochondrial DNA (mtDNA) was sequenced for 60 individual samples from eight localities across the species' geographic range. Relationships among haplotypes were inferred by using phylogenetic analyses (Maximum Parsimony, Bayesian and networks), Bayesian and networks). Genetic structure and demographic history were analyzed through different statistics, mismatch distributions, neutrality test (Tajima's and Fu) and AMOVAs. A total of 26 haplotypes were found, most of them restricted to single populations. The presence oh unshared haplotypes was consistent with the low migration rates. The northern, central, and southern regions of the distribution range (between 29º S and 39º S) differed in both the level and distribution of genetic variation (southern and northern populations showed higher genetic diversity values than central populations). Populations of central populations were fundamental in determining this degree of differentiation (due to their frequency and compisition). AMOVA analyses conducted for three population groups (northern-central-southern) were significant, indicating a moderate level of geographic structure for all populations. The low genetic diversity (haplotype and nucleotide) in central populations could suggest a posible population bottleneck associated with Pleistocene glaciations or with an intense volcanic activity on this part of the red viscacha's range. The phylogeographic structure was moderate; the analyses recovered two principal clades: A (with central and southern distribution) and B (with northern and southern distribution). Most of the populations were polyphyletic, indicating that they would not have been isolated long enough to reach reciprocal monophyly. Demographic analyses conducted for each clade (A and B) resulted in negative values for the neutrality test (Tajima's and Fu's) and in a unimodal mismatch distribution, suggesting a recent history of population expansion. |
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| Descripción Física: | 115 h il.,fig.,2CDRom (texto completo, versiones ISO y UDF) 29,5 cm |